La CPTS doit pouvoir apporter une réponse en cas de crise sanitaire grave au travers de la mise en œuvre d’un plan d’action. Le plan devra être rédigé par la CPTS selon une trame nationale la première année de mise en œuvre de la mission, puis sera mis à jour annuellement. Une trame nationale définit les modalités de réponses à 5 typologies de crise sanitaire. Les lignes directrices présentent 4 grandes actions qui devront être déclinées par la CPTS dans son plan d’action : anticipation, adaptation, pilotage et évaluation de la réponse apportée.